『ポケモンユナイト』の舞台は、海の果ての秘境と噂されていた幻の島、「エオス島」。ここで行われるチーム戦のポケモンバトルは、「ユナイトバトル」と呼ばれている。ユナイトバトルは、ポケモントレーナー同士がチームを組み、時間内で得点を競う試合形式。しかも参加するポケモンたちは試合の中で成長・進化するという、他に類を見ない特別なポケモンバトルだ。世界中に熱狂的なファンが存在する、まさにトレーナー憧れの舞台!
ユナイトバトルには、「ユナイトライセンス」のあるポケモンの中から1匹を選んで参加する。
「ユナイトライセンス」は、ユナイトバトルをするたびにもらえる「エオスコイン」を使うと手に入れることができるぞ!
ユナイトバトルの勝敗は、試合時間が終了した時のチームのスコアによって決まるぞ。スコアを獲得するためには、野生のポケモンを捕まえることで手に入るエオスエナジーを溜めて、相手サイドにあるゴールに入れる必要がある。相手チームのポケモンが妨害してくるので、スコアを獲得するのは一筋縄ではいかないぞ!